《基因组》读书笔记
一号染色体生命
生命是很难定义的，但生命有两种能力：自我复制和建立秩序。
RNA是联结DNA和蛋白质的物质，它将信息从DNA的语言翻译成蛋白质的语言。RNA的出现先于蛋白质和DNA。
- 要改变DNA的组成部分，必须通过改变RNA相应组成成分的方式来实现，而无法直接进行更改。
- RNA可以完成自我复制，观察细胞的任何一个部分，你就会发现最原始、最基础的功能都需要RNA的参与。
- DNA语言中的T是由RNA中的U演化而来的
- 现在有很多酶，虽然其成分是蛋白质，但必须依赖一些小的RNA分子才能发挥作用。
- RNA本身就可以作为催化剂，切断或连接其他分子（包括RNA本身在内）
现在看来，最初的基因应该是兼具复制与催化的。它很可能就是由RNA构成的。RNA的一部分序列的功能就是催化自身，进行复制和翻译等过程，而不需要外来物质的介入。令人震惊的是，最后筛选出来的RNA片段和1号染色体内的5S基因结构相似。曾经，那是RNA的世界。
这些核糖生物面临考验，RNA是一种不稳定的物质，几个小时之内就会分解掉。很长时间的适应，终于进化出更坚强的类型——DNA，还创造了一个从DNA复制RNA的系统。基因信息中的3个字母分为1组，同时进行复制，每3个字母都带有一个氨基酸“制成的标签”。核糖体查找这些标签，翻译成氨基酸，最后组成蛋白质。
最早的时候，基因并非来自父母。许多细菌可以通过吞噬其他细菌获得基因。因此，人体内的基因也许来源于许多不同的物种。
我们不是来自某个个体，而是来自某个“共生体”。
三个字母组成的遗传密码在所有生物体内都是一样的。CGA代表精氨酸，GCG代表丙氨酸——无论蝙蝠、甲虫、榉树、还是细菌，都是如此。所有生物都使用同样的遗传密码和解码词典。
这意味着只有一次创世纪，生命是在这唯一的创世纪里被创造出来的。
二号染色体物种
黑猩猩、大猩猩和红毛猩猩都有24对染色体，而人有23对。在猿类动物里，我们人类是个例外。
二号染色体是由两对中等大小的猿类染色体融合而成的。人类灵魂的基因也许就注入在靠近二号染色体中间的地方。
人类经历了很多失败。
500万年前，我们的猿类祖先输给了“基因更好”的猴子，几乎灭绝。
4500万年前，我们的灵长类祖先输给了啮齿动物，几乎灭绝。
2亿年前，我们的爬行动物祖先输给了恐龙，几乎灭绝。
3.6亿年前，我们的远古祖先叶鳍鱼输给了条鳍鱼，几乎灭绝。
5亿年前，我们的脊索动物祖先，输给了节肢动物的环境适应能力。
到今天，人类取胜了。
几十亿年间，亿万生物被创造出来，单细胞生物不计其数，大量生物周而复始地走向死亡。
灾害总是倾向于给更大、更复杂的生物带来灭顶之灾。
那些最聪明的动物的大脑，每一代都会变得更大。现代>新生代>中生代>古生代
除二号染色体是由两对中等大小的猿类染色体融合而成之外，人类和黑猩猩的染色体之间的差距微乎其微。
有13对染色体不见丝毫差别。平均每100个字母里，平均只有不到2个不同。可以说有98%的基因序列与黑猩猩相同。
普遍认为是500-1000万年前，人和猿类开始分离。人类繁衍了不到30万代。
有个猜想，人类的祖先只是当时与其他猿类隔绝的一个小分支。被阻隔在了一块相对干旱开阔的草地上。大约每过10万年，大脑就会增加1.5亿个脑细胞。
大脑体积变大，需要肉类食物；两性分工，分享食物增加了吃肉的可能；分配食物需要有复杂的大脑；两性的分工推动了一夫一妻制的形成。如此这般，周而复始。
2%的内容，讲述了人类与黑猩猩的不同。可以说，关于我们过去的记录都刻在了基因里。
三号染色体历史
基因的主要功能是储存制作蛋白质所需的配方。几乎体内所有的化学作用、结构形成和功能调节都是依靠蛋白质完成的。
孟德尔豌豆实验，成就在于他揭示出：大部分遗传物质看上去似乎融合在了一起，其原因是这些遗传物质是由多种不同的“微粒”构成的。
穆勒的重要发现是基因突变可以人工诱发。
DNA是一种双螺旋结构，好似两条缠绕在一起的精美电梯，长度可以无限延长。这个密码能够进行自我复制，还指明了蛋白质的配方。
发现密码的存在是很容易的，只需将猜测、物理学知识和灵感结合起来就可以了，但要破译密码，却需要真正的天才。
“无逗号基因密码”的理论是错误的，因为它无法容纳“移码突变”的存在。在这个理论下，一旦出现移码突变，一个字母的丢失就会导致之后的所有字母都变得毫无意义。相比之下，大自然选用的方法兼容性更强。能够经受住其他错误。用很多不同的三个字母的组合，可以表达同一个意义（氨基酸）